养殖水质量好的会减少细菌的滋生，从而减少疾病的发生，养殖水质量差的容易滋生细菌和寄生虫，从而导致疾病爆发。维持水体环境平衡何其艰难，天气的突变、人为操作不当、机器故障等因素都会破坏水体的环境，导致养殖水质量变差，从而引发一系列问题。广州环控农业生物科技有限公司就如何维持水体环境、提高养殖水质量方面花了大量的时间去研发，为了能够更有效、更科学、更环保去进行水产养殖。目前已取得不错成效，很多客户采用了广州环控研发的循环水养殖设备、循环水养殖系统、生物絮团养殖系统、集装箱养鱼设备后，养殖产品不仅质量提高了，产量也提高了，养殖周期缩短了。
我国是世界上水产养殖规模大的国家，但由于传统养殖方式存在的规范化程度低、养殖模式简单、水资源浪费大、污染严重等问题，导致产能严重滞后。近年，由中国水产研究院联合相关科研和推广部门，对工厂化循环水养殖系统开展了全面研究。我国的南方地区海岸线长，网箱和土塘养殖发达，但存在各种鱼、虾苗种供应不足和孵化育苗存活率低、台风等自然灾害较多、工业污染水源等问题。
养殖过程中产生的残饵、粪便，有部分无法通过换水排出而吸附在池壁池底。洗池对于排出养殖池底的污物有一定效果。无死角的养殖池形状结合向中央倾斜的池底和中央排污方式，可以有效的排出池底污物。当同一个养鱼池中鱼的大小、强弱不一时，会严重影响鱼的生长速度，因而，养殖过程中必须按时进行大小分选。鱼的大小分选不仅可以防止互残（半滑舌鳎的互残的情况很少发生），而且便于进行管理，尤其是幼鱼，幼鱼生长比较快，分选和不分选，幼鱼的生长、死亡率和饵料的利用率相差很大。但要尽可能减少分养次数，过多次数的分养会使鱼体受伤，增加鱼的应激反应。