循环水养殖系统难点是解决氮循环的问题，要消除氨氮和亚硝(xiao)酸氮的影响。环控公司的解决方案是在循环水养殖系统中加入了反硝化反应池，但由于反硝化作用需要在严格厌氧条件下进行，因此硝化作用反应池需要跟反硝化作用反应池分开。目前循环水养殖设备已实现工厂化生产，做到了养殖池与养殖净化设备的无缝连接。通过一系列的物理过滤、化学沉淀以及通过微生物的作用去除氨氮、硝氮和亚硝氮再通过杀菌消毒、充氧等操作，水体重新流回到循环水养殖系统中，实现养殖水的循环利用。
突破海水工厂化循环水养殖的技术难点 集成国内外先进水处理技术，创新海水养殖水处理新模式、新技术，开发“经济(造价低)、实用(满足生产功能要求)、好用(生产管理方便)”，能够满足不同用户、不同养殖对象生产需求的设施设备。研究工厂化循环水养殖的关键生产技术 高密度养殖条件下，密度胁迫作用会引起动物机体产生一系列生理变化，研究养殖对象在高密度环境下的适应机制，掌握养殖和育苗生产中的适当放养密度。
生物絮团技术是指通过操控水体营养结构，向水体中添加有机碳物质，调节水体中的C/N比，促进水体中异养细菌的繁殖，利用微生物同化无机氮，将水体中的氨氮等养殖代谢产物转化成细菌自身成分。并且通过细菌絮凝成颗粒物质被养殖动物所摄食，起到维持水环境稳定、减少换水量、提升动物免疫力、提高养殖成活率、增加产量和降低饲料系数等作用的一项技术，它被认为是解决水产养殖产业发展所面临的环境制约和饲料成本的有效替代技术。