高密的养殖下，一旦系统崩溃、疾病爆发或循环水养殖系统运行的稳定性和系统总水量的平衡、生物滤池的维护、过滤设施的定期清理、合理的投喂策略、适宜的养殖密度以及水质的检测和疾病的预防都是分不开的。因此，循环水系统的科学有效运行是多学科知识的综合体现。研究调查发现，很多企业对循环水养殖的原理、水处理设施设备的作用、运行参数等知之甚少，直接影响到系统的运行管理。较高的进入门槛也进一步加大了循环水养殖模式的推广难度。
循环水处理系统设备是一种环保水处理的方式。随着工业的快速发展，大量的工厂化水产养殖项目、市政污水、泳池工程等方面都需要对水进行循环处理、综合利用。以期达到低碳减排的目的。水处理设备多年来专注于循环水处理特别是水产水族相关的循环水处理设备的研发与生产。在相关系统的设计与设备的改进上积累了丰富的经验。循环水系统处理的对象一般是含有大量固体悬浮物或溶解性的物质，这些物质排入到养殖水中后会在细菌的作用下，分解成氨、硫化氢等对水生动物有毒的物质。因此，一时间将这些污染物截留并尽可能地将这些污染物变废为宝，是循环水处理系统的功能所在。
气压的降低，造成水体对氧的溶解度降低，导致水体缺氧。在气压低的情况下，常可见水体底部污染物泛起，这就是所谓“泛塘现象。“泛塘”的结果造成水底因缺氧而抑制的好氧菌重新得到获取氧气的机会，由此急剧消耗水体溶氧。工厂化循环水养殖模式仍然是未来具有发展潜力的陆基循环水养殖模式, 是中国开创现代水产业的重要组成部分。随着核心装备的国产化、水处理工艺的成熟化、养殖管理的科学化, 集“装备工程化、技术现代化、生产工厂化、管理工业化”为一体的现代工业化养殖产业新模式将会被建立, 水产业的转型升级, 海淡水养鱼大产业的架构, 才能够实现, 而中国水产业将进入工业化养殖新时代, 届时, 中国不仅是世界水产大国, 也同样会是世界水产强国。