工厂化循环水养殖系统不仅节能节水效果较好，而且还对防止养殖病害发生、实现养殖过程零用药、提高产品质量和经济效益发挥重要的作用。
养殖过程中产生的残饵、粪便，有部分无法通过换水排出而吸附在池壁池底。洗池对于排出养殖池底的污物有一定效果。无死角的养殖池形状结合向中央倾斜的池底和中央排污方式，可以有效的排出池底污物。当同一个养鱼池中鱼的大小、强弱不一时，会严重影响鱼的生长速度，因而，养殖过程中必须按时进行大小分选。鱼的大小分选不仅可以防止互残（半滑舌鳎的互残的情况很少发生），而且便于进行管理，尤其是幼鱼，幼鱼生长比较快，分选和不分选，幼鱼的生长、死亡率和饵料的利用率相差很大。但要尽可能减少分养次数，过多次数的分养会使鱼体受伤，增加鱼的应激反应。
构建的工厂化循环水养鱼系统，主要通过优化集成一批节本、节能型养殖设施及水处理技术，包括单元式养殖池、生物移动床、截留沉淀、气提泵等，在保证系统水处理效果及生产能力的同时，有效降低了系统运行能耗。以同等养殖密度为40kg-50kg/m3，每日换水量为5%-10%/天计算，系统整体运行能耗相对于常规典型的循环水养殖系统可降低30%左右，比较符合我国可持续发展与健康养殖要求的，是一种具有良好推广应用前景的工厂化循环水养殖模式。