在分解细菌的作用下，再进一步转化成了氨。被鱼类吃掉的一部分经过鱼类的消化，也转变成氨。殊途同归的氨在分子态时是一种剧毒物质。在硝化细菌的作用下，它会被转化成亚盐。亚盐是一种不太稳定的物质。在高氧化还原电位的情况下，会被氧化成亚盐。此时如果有反硝化细菌，盐就会被转化成N2从水中溢出。这样，水体中的氮元素就完成了一个完整的转化分离过程。 在实践中，生物过滤的细菌需要适宜的条件才能起到相应的作用。如水体的温度、PH、溶氧量、合适的碳氧化、杀菌剂等。因此，不仅要求其他系统设备与生物过滤器配套，更对操作者有一定的技术要求。
造成桃拉病毒滋生的主要原因就是养殖水的水质控制问题，使用外塘养殖模式到了一定时间，水质相对会比较差，这时候就会滋生各种各样的病毒。广州环控农业生物科技有限公司为了提高养殖水的质量，进行了长期的实验和研究，结合循环水养殖系统和生物絮团养殖技术，打造了一个适合养殖对虾的养殖模式。运用循环水养殖设备，可以有效改善水质环境，而且节约水能，同时可以进行高密度养殖对虾，产量比外塘养殖要高出10倍有余。
工厂化循环水养殖系统不仅节能节水效果较好，而且还对防止养殖病害发生、实现养殖过程零用药、提高产品质量和经济效益发挥重要的作用。