工厂化循环水养殖系统不仅节能节水效果较好，而且还对防止养殖病害发生、实现养殖过程零用药、提高产品质量和经济效益发挥重要的作用。
每平方米放苗250～400尾，暂养后的大虾苗放养密度可减少20%～30％；实行三级养殖时**级每平方米可放养虾苗1000～1200尾，二级每平方米放养500～800尾，三级每平方米放养250～300尾。在低盐度或淡水中养殖凡纳滨对虾时，必须对虾苗进行淡水驯化。在育苗室淡化速度每日盐度降低不超过5，降至5时便可直接向微盐池塘中放苗。在淡水池养殖，应选择在盐度1以下水中稳定培育3天以上的虾苗，亦可先向池塘内加入20～30厘米的淡水，再用出盐前的卤水或海水素（精）调节至适宜的盐度放养虾苗，经数日暂养后，再逐日加入淡水。
在目前的发展水平下，循环水养殖模式较高的准入门槛使得循环水养殖与普通低附加值鱼类无缘，而名贵海水鱼类可养殖品种有限，限制了循环水养殖模式的发展。近些年来，经过专家学者和众多的养殖企业的不断探索，国内循环水养殖品种的丰富度大大提高，如：斑石鲷、墨瑞鳕鱼、黄条鰤等。循环水养殖系统既是一个复杂的系统工程，又是一个矛盾的综合体，因此，不可能存在一种十全十美、适用于所有养殖品种的循环水养殖系统，只要不出现明显的设计漏洞，系统运行过程中遇到的很多问题，可以通过系统管理技术和养殖技术来解决。