工厂化循环水养殖系统是以工业化手段主动控制水环境，水资源消耗小、占地少、对环境污染小、产品优质安全、bing害少、密度高、养殖生产不受地域或气候的限制和影响，资源利用率高，是高投入高产出，低风险实现水产养殖业可持续发展的重要途径。机械过滤系统 机械过滤系统的主要功能就是通过不断的循环，将水中鱼类的粪便及多投的饲料等固体颗粒及胶体状物质过滤分离出去。以避免它们留在养殖水体中继续分解成对水生生物有毒的氨氮等物质。 机械过滤系统设备分很多种，常见的有微滤机、蛋白质分离器、过滤沙缸、精密过滤器等。微滤机经过水产设备的精心设计，早已实现全自动化。
在藻类生长所需的大量元素中，磷、氮通常是水体浮游植物增长的限制性因子，总氮大于1.2毫克/升、总磷大于0.11毫克/升时水体开始富营养化，在淡水中当总磷小于0.1毫克/升时藻类生长发展为磷限制。而过高的磷输入如总磷为1.65毫克/升，并不能促进藻类生长。要培养出养殖所需要的有益藻、抑制蓝藻、裸藻等有害藻，我们需要重点关注一些化学指标，总碱度、硬度、盐度、氮、磷、碳以及微量元素钙、铁、锰、锌等有可能成为限制性因子的指标。池塘中的有机质含量可通过检测水中有机耗氧量得知，水中有机质含量高，氮磷的含量也会高，在降氨氮同时可以降低水体有机质含量。
循环水养殖系统（recirculating aquaculture system，RAS）作为一种新型养殖模式，通过一系列水处理单元将养殖池中产生的废水处理后再次循环回用。其主要原理是将环境工程、土木建筑、现代生物、电子信息等学科领域的先进技术集于一体，以去除养殖水体中残饵粪便、氨氮（TAN）、亚硝（xiao）酸盐氮（NO2--N）等有害污染物,净化养殖环境为目的，利用物理过滤、生物过滤、去除CO2、消毒、增氧、调温等处理将净化后的水体重新输入养殖池的过程。其不仅可以解决水资源利用率低的问题，还可以为养殖生物提供稳定可靠、舒适优质的生活环境，为高密度养殖提供了有利条件。