紫外线杀菌器是一种将飞利浦紫外线杀菌灯设置在PVC管道内的一种水处理设备。水经过过滤后，透明度增加，再经过紫外线杀菌器的管道时，水中的细菌、病毒、微藻种子等，都被杀死。紫外线杀菌器的优点就是杀菌消毒的同时，无任何残留物质生成。 当水经过杀菌消毒后，由于后面的蛋白质分离器和生物过滤器的出水都是自动流回鱼池的，所以，应将冷暖机、蛋白质分离器和生物过滤器并联。也就是，紫外线杀菌器的出水通过三通，分成三路。分别去向冷暖机、蛋白质分离器和生物过滤器。
我们应该用目标产量和预算来衡量需要做多大面积的工厂化循环水养殖系统，而不是简单的用面积来做对比。工厂化循环水养殖系统前期投入相对较高，如果简单套用原来池塘养殖的经验和面积，总投资额会是一个很庞大的数字，普通养殖户难以接受，也无形中放大了工厂化循环水养殖的高投入印象，不利于养殖户对工厂化养殖产生合理的理解。在从传统池塘养殖转换到工厂化循环水养殖的过程中，我们可以用一个简单的比例来进行换算，同样的产量，工厂化循环水养殖仅需池塘养殖面积的10%。有了这个比例，就能更科学的规划养殖面积和预算。
在分解细菌的作用下，再进一步转化成了氨。被鱼类吃掉的一部分经过鱼类的消化，也转变成氨。殊途同归的氨在分子态时是一种剧毒物质。在硝化细菌的作用下，它会被转化成亚盐。亚盐是一种不太稳定的物质。在高氧化还原电位的情况下，会被氧化成亚盐。此时如果有反硝化细菌，盐就会被转化成N2从水中溢出。这样，水体中的氮元素就完成了一个完整的转化分离过程。 在实践中，生物过滤的细菌需要适宜的条件才能起到相应的作用。如水体的温度、PH、溶氧量、合适的碳氧化、杀菌剂等。因此，不仅要求其他系统设备与生物过滤器配套，更对操作者有一定的技术要求。