医院污水处理主要是消毒，即杀灭病原体。常用的方法是氯化消毒或用臭氧消毒（见水的消毒、废水氧化处理法）。医院排出的放射性废水常用贮存衰减法处理。医院常用的放射性同位素如131碘,32磷,198金，24钠等是半衰期较短的同位素，因此可以将放射性污水贮存于地下专用衰变水池内，贮存时间为10倍于半衰期，把放射性浓度降到容许排放的程度。如果放射性污水的浓度很低，水量很小，也可用稀释法处理。中国的《放射性防护规定》要求每一微居里放射性同位素达到容许排放浓度需稀释水量1.67米3。当放射性污水浓度很高，放射性的半衰期很长，不宜用贮存法和稀释法处理时，可用蒸发法、离子交换法或凝聚沉淀法进行分离浓缩处理（见放射性废水处理）。
重金属废水的治理，必须采用综合措施。首先，从根本上是改革生产工艺，不用或少用毒性大的重金属；其次是在使用重金属的生产过程中采用合理的工艺流程和完善的生产设备，实行科学的生产管理和运行操作，减少重金属的耗用量和随废水的流失量；在此基础上对数量少、浓度低的废水进行有效的处理。重金属废水应当在产生地点就地处理，不同其他废水混合，以免使处理复杂化。更不应当不经处理直接排入城市下水道，同城市污水混合进入污水处理厂。如果用含有重金属的污泥和废水作为肥料和灌溉农田，会使土壤受污染，造成重金属在农作物中积蓄。在农作物中富集系数较高的重金属是镉、镍和锌，而在水生生物中富集系数较高的重金属是汞、锌等。
景观水处理处理工艺：针对这类富营养化问题突出的水体处理工艺，主要采用生态控制为主，人工控制为辅的方法来控制。首先通过不对称纤维过滤设备、光催化杀菌除藻设备和湖泊推流系统，除去湖泊水体中浮游藻类，同时在系统运行过程中，抑制湖泊浮游藻类的生长，必须保证浅水区清澈见底，其中浅水区要做到清澈见底，创造水生植被恢复的条件，在此基础上，恢复湖泊的沉水植被和挺水植被，沿湖泊浅水区种植沉水植物和挺水植物，不仅具有美化人工湖的功效，还能增加了人工湖的生物多样性，建立复杂而稳定的生物链，又减少了水体中存在的各种污染物，从生态上防止水体发生富营养化现象，同时沉水植物分泌化学物质来抑制藻类的大量繁殖，如金鱼藻、狐尾藻、苦草等就属于这类沉水植物。在湖心及周边设置4-10个生物浮岛，增加湖泊的景观效果，消减湖泊水体中N、P等营养盐，通过水生植物的化感作用，抑制水体中藻类生长，恢复湖泊洁净好氧生态系统，保持湖泊清澈、碧绿的景观效果。